控制的，总参谋部只是沟通各国，并军事情报共享等。
指挥方面是由秦琅任命的统领处负责，总统领也是舰队的最高指挥官，下面几个统领副统领分别负责人事、训练、装备、后勤等。
联合舰队不属于吕宋武装序列，是隶属于南洋宣慰司的，所以也算是唐军，他们的主要职责，就是维护南洋地区安宁稳定，打击海贼，护卫航线，保护商船，甚至海上救援，以及有义务和责任，打击联盟各国内的叛乱份子等。
尤其是这后面的这一条，甚至为联合舰队干涉盟国内政留下了窗口。
所以这支拥有一万海陆部队，主基地在南洋秦家锡港，分基地设在马六甲狮港、巽它海峡椰港，以及处于印度洋上孟加拉湾与缅甸海之间安达曼群岛中的秦家安澜港。
还有处于爪哇与小巽它群岛之间的巴厘岛上的伏波岛。
一主四副，联合舰队五个基地，除了椰港属于秦家租界山帝王朝的租界外，其它的都是秦家自己的海外领地。
尤其是位置上，这五个基地正是处于南洋的几个重要航线上，特别是处于进出南洋的几个必经之处。
要进出南洋，绕不开联合舰队的基地。
秦琅当初离京之前，亲自向皇帝讨要南洋宣慰使之衔，就是为了能够更进一步的加强对南洋地区的话语权，而掌握了一支万人的南洋舰队，则这个南洋宣慰使可就不仅仅是个空衔了。
而是实实在在的对南洋地区诸国有了很强的影响力，特别是再加上近年越来越成熟，让各国都大为得利的南洋香料同盟，让整个南洋地区已经越来越紧密。
秦琅从没想过要吞并整个南洋，这不现实。
但加强南洋的联盟关系，形成一个以吕宋为盟主的紧密联盟，却是值得去努力的。
而现在，经过小二十年的努力，这个联盟在经济贸易，区域安全等方面，都有了不错的进展。
尤其是秦琅通过和亲结盟，这些年十国之间可是打的火热，秦琅的一众儿孙中，可就有许多娶了其它九国的公主们，而秦琅也把不少义女、义孙女，甚至是庶出孙女们嫁到了各国给王公贵族们。
再加上这些年秦琅还一直努力在十国推行儒教儒学，推行汉话，甚至在努力的推行唐制标准度量衡，这都使的如同围绕着南洋的这区域十强国，形成了一个儒家汉文化圈。
如今联盟每年都会在旧金山和狮港举行春秋议会，秋天在旧金山，春天在狮港，偶尔也会中途在锡港、椰港、新金山或是公主港、上海、宁波、嘉兴、千湖等诸港举行联盟高级官员会议。
曾经的南洋强国骠越、南奔、堕罗和等国都已经被大唐先后灭掉，这二十年间，十国也一样又吞并了不少各自势力范围内的小国和部落，这些都是得到联盟默许甚至支持的。
只要不触犯到其它盟友的势力范围，大家都互相支持，甚至有时还会应邀出兵协助，反正也是有报酬的，比如吕宋就几次不仅战舰船只和武器铠甲的军售，甚至还直接出动了水师，事后秦家也没亏，军售本就很赚钱，而出兵支持后，也按协议战后获得了大量的奴隶、香料等做为报酬。
联合水师也基本上每次都会出兵支持，这也是一种实战练兵，又是加强舰队的威信力，同时也是赚外快的时候。
这种情况下，南洋如今哪还有什么成气候的海盗，就算有，也是一些啥也不是啥也不懂的土著蛮夷或是亡命之徒，但这些人难成气候，旋起旋灭。
南洋各港，经常会有些海贼首领被吊死示众，至于一般的海贼成员，是没资格被吊死，也不会被浪费的，他们一般会卖为奴隶，被吕宋贵族们买去庄园种种植农奴或是去矿山开矿又或是在船厂铁厂等作坊做工。
当然，运气更差一点的，或者是一些血债累累的心狠手辣之徒，也会被判送去南定州流