上火影的年代。
“我一直在逃避，大蛇丸的出走，水门的死，我又何尝不是帮凶。如果事情回到最开始，我们一起抵制木叶所有的黑暗，又怎么会有今天这种事情发生。”自来也的白发在猎猎的风中飞舞，这一次，他眼神极其认真，没有一丝开玩笑的意思“我想要赎罪，我要当一把火，一把敢于点燃木叶，烧尽所有污秽照亮所有黑暗的火，我要让木叶再也藏不下一丝苟且，我想这可能是大蛇丸最初想要的，水门最初想要，和我一直想要，不敢去做的。”
「你……」
纲手默默的听着，忽然大步踏出来到自来也面前，狠狠一拳将自来也脚下的岩石打得粉碎。
“自来也，如果你做不到你说的，天涯海角，我也要杀了你。”纲手的眼眶通红，双拳狠狠的攥着，看着山下一片狼藉的木叶“现在，谁要是敢阻拦你，我就帮你杀光他们！”
这一天，木叶的忍者和平民都异常匆忙，医疗班也全体出动，在木叶里登记着消失的人，并试图在残垣断壁中寻找幸存者。自来也和纲手则第一时间拜访了日向一族和奈良一族，于当晚在日向日足，奈良鹿久和其一族所有上忍的帮助下，迅速接管了木叶的暗部和根部。
木叶六一年
根部首领团藏伙同叛忍大蛇丸，间谍陆川危害木叶，在猿飞日斩，阿斯玛，秋道丁座，山中亥一，奈良鹿久，辉夜晴，凯等人阻止下，三名作乱忍者全部被击杀。
三代火影猿飞日斩，木叶上忍猿飞阿斯玛，秋道丁座，山中亥一等以身殉职。
木叶根部被清洗，顽固不化者当晚被自来也和纲手击杀，其余人员皆归于纲手部下，交由纲手管理，戴罪立功。
木叶暗部人员打乱，重新部署，大量日向一族忍者加入暗部及火影卫队。
同日管理木叶政务机构的高层顾问转寝小春和水户门炎因会议上反对自来也继任火影，在散会后回族路上被擅长体术的忍者击杀。
次日，自来也继任第五代火影，纲手掌管木叶根部，奈良鹿久任木叶高层顾问，日向日足协助管理暗部。木叶警卫队则从各族忍者和平民忍者中共同选拔，统一交由木叶上忍辉夜晴管理。
同日。
日向雏田晋升中忍，宇智波佐助晋升中忍，漩涡鸣人晋升中忍，被第五代火影收为弟子。
雾隐村。
枸橘仓矢看着茫茫大海，有了轻生的念头。