自己亲自给李存写战报，如果没有时间，李显忠就让参谋代他写战报，然后盖上他自己的帅印。）
此战大体上的经过是：
洪武二十三年六月初一，南路乾军的先锋军从合浦（后世的镇海湾马山浦附近）出发后，三日后成功登陆对马岛，全歼岛上日守军。
六月十二傍晚，统领李枢（李存的儿子之一）率领本部一千余人登陆壹岐岛，日军守卫率领百余骑兵拦阻，被全歼，守军随后又率两百余骑与李枢部激战，李枢部以虎蹲炮、轰天雷、燧发枪应战，日军不敌，退守城内。
李枢是李存的儿子中又一个很有指挥才能的人，他入伍仅不到两年时间，就被不知道他身份的李显忠给火线提拔为统领，并让能征善战的他担任伐日本一战的先锋官。
次日，随后赶来的南路先锋军统制董先，亲自率领南路先锋军攻城。
仅一顿饭时间，对马城就彻底被南路乾军先锋军攻破，守将见此，很有气节的选择了自杀。
南路乾军的先锋军随后在董先的率领下准备到博多湾登陆。
可惜，在南路乾军先锋军逼近肥前沿海岛屿时，遭到肥前守军的英勇抗击。
双方经过一番激战，日军不敌，死伤惨重，南路乾军先锋军成功登陆博多湾后，进逼今津。
这里的地形并不利于大部队展开，距日本的大宰府又仅有一日行程，于是董先于当晚又撤回到船上，准备次日清晨重新登陆发动进攻。
次日，董先将南路乾军先锋部分为东西二路在博多湾登陆。
早已经收到乾军前来攻打日本的消息的鸟羽法皇，通过院厅下答院宣，聚集九州诸国部队总数约为五万日本武士，准备阻止南路乾军登陆九州岛。
董先分出来三千马军由李枢率领在百道原登陆，日军派五千骑兵前来迎战。
李枢率领三千马军在博多湾东部的博多箱崎成功登陆，击败五千主动前来迎敌的守军，占领岸边松林，然后又从背后突袭在百道原同董先率领的南路乾军先锋军作战的日军主力。
日军主力腹背受敌，死伤惨重，余部向太宰府水城方向撤退。
初次交锋过后，鸟羽法皇已经知晓乾军的厉害，于是他紧急下令：各地守护回国征发全国六十五岁以下的男子充当预备役士兵，各寺院的僧兵也被动员起来保卫国家，加强军备建设。
同时，鸟羽法皇对各国武士也作出了细致的分工：四国、九州地方的武士在本地加强防御；中国地方的武士防守堪称西门锁钥的周防、长门，并随时准备支援四国、九州的抗战；京畿、关东地方的武士驰援京都；奥羽地方的武士也要随时做好战斗的准备。
从鸟羽法皇的部署上不难看出，鸟羽法皇已经意识到，这将是一场倾国之战。
不过，鸟羽法皇到底还是一只井底之蛙，他根本就不明白，就算他们日本倾国一战，也丝毫胜算都没有。
几日后，李显忠率领南路乾军的主力攻到了大宰府。
大宰府是日本九州的地方行政机关，相当于地方都城，也相当于日本的陪都，是日本连接世界的西都。
总之，大宰府对于日本而言，极为重要，不容有失。
所以，日本朝廷不得不组织十万大军与乾军决战。
此战，李显忠亲自坐镇指挥，以红衣大炮开路，将日军打得落花流水，最终只有不到三万日军逃去了四国，其余日军均被击杀或是擒获，九州岛至此画入大乾王朝的版图。
李显忠将太宰府作为乾军在日本的大后方，留下都监张狗蛋坐镇这里，同时又留下董先率领南路乾军先锋军清剿九州岛上的日本残军，然后继续亲自率领南部乾军的主力北上攻打周防和长门，想要彻底打开日本的门户。
李显忠又分出一支偏师，由老将王禀率领，前去攻打四国岛