骨子里对于朝廷也是不信任的。
现在朝廷要求在大宗贸易中使用朝廷银行所发行的票据，以取代之前的直接货币交易，这对于他们来说显然是极为抵触的，一来使用票据之后，逃税就显然要麻烦很多，二来就是他们对于朝廷还是不信任的，虽然朝廷承诺这些票据可以兑换相应的货币，但是自己要将白花花的银钱存入朝廷的银行之中来换取票据，这对于这些豪商来说自然是不干的。
他们认为朝廷对于经济的管束和控制过于严厉，禁榷过多，才是现在大明贸易所面临的最大问题，由于朝廷掌握了重要物资的专卖权，使得在这些可以稳定获得高利润的行业里只有少数跟官府有关的官商。多数的民间资本很难挤进获利。而官商的经营却又和政治的局势紧密相关，朝堂上斗争的结果直接决定商人的钱途。所以就连这一小部分的官商，也不肯持续扩大生产投入。而宁可利用民间放贷这种简便快捷的资金增值的办法。
他们也担心出现人亡政息的局面，一旦太子或者是主持此事官员去任，这些政策能否继续实施下去，就很成问题了，这点朱载坖认为确实是有道理的，但是这并不是他们对抗朝廷政策的理由，朱载坖认为还是要派遣能臣赶赴闽浙处理此事。
申时行当即推荐现任苏州知府石昆玉，认为他刚直不阿，当然朱载坖其实是很清楚的，申时行对于石昆玉是极为头疼的，石昆玉以廉直着称，因依法按治宰辅申时行内亲吴之祯而得罪申时行，之前申时行本想收拾一下他的，但是朱载坖却对石昆玉很欣赏，特旨加右佥都御史仍知苏州府，申时行这次正好借这个机会将石昆玉弄走。